[ol7_developer_EPEL] python-ase-3.13.0-1.el7.noarch

The Atomic Simulation Environment (ASE) is the common part of the simulation
tools developed at CAMd. ASE provides Python modules for manipulating atoms,
analyzing simulations, visualization etc.

Filelist (Show Changelog) (Show related packages)

• /

  • usr

    • bin

      • ase-build

      • ase-db

      • ase-gui

      • ase-info

      • ase-run

    • lib

      • python2.7

        • site-packages

          • ase

            • __init__.py

            • __init__.pyc

            • __init__.pyo

            • atom.py

            • atom.pyc

            • atom.pyo

            • atoms.py

            • atoms.pyc

            • atoms.pyo

            • autoneb.py

            • autoneb.pyc

            • autoneb.pyo

            • build

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • __main__.py

              • __main__.pyc

              • __main__.pyo

              • adsorb.py

              • adsorb.pyc

              • adsorb.pyo

              • bulk.py

              • bulk.pyc

              • bulk.pyo

              • general_surface.py

              • general_surface.pyc

              • general_surface.pyo

              • molecule.py

              • molecule.pyc

              • molecule.pyo

              • ribbon.py

              • ribbon.pyc

              • ribbon.pyo

              • root.py

              • root.pyc

              • root.pyo

              • rotate.py

              • rotate.pyc

              • rotate.pyo

              • supercells.py

              • supercells.pyc

              • supercells.pyo

              • surface.py

              • surface.pyc

              • surface.pyo

              • tools.py

              • tools.pyc

              • tools.pyo

              • tube.py

              • tube.pyc

              • tube.pyo

              • voids.py

              • voids.pyc

              • voids.pyo

            • calculators

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • abinit.py

              • abinit.pyc

              • abinit.pyo

              • aims.py

              • aims.pyc

              • aims.pyo

              • amber.py

              • amber.pyc

              • amber.pyo

              • ase_qmmm_manyqm.py

              • ase_qmmm_manyqm.pyc

              • ase_qmmm_manyqm.pyo

              • calculator.py

              • calculator.pyc

              • calculator.pyo

              • castep.py

              • castep.pyc

              • castep.pyo

              • checkpoint.py

              • checkpoint.pyc

              • checkpoint.pyo

              • cp2k.py

              • cp2k.pyc

              • cp2k.pyo

              • dacapo.py

              • dacapo.pyc

              • dacapo.pyo

              • demon

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • demon.py

                • demon.pyc

                • demon.pyo

              • dftb.py

              • dftb.pyc

              • dftb.pyo

              • eam.py

              • eam.pyc

              • eam.pyo

              • elk.py

              • elk.pyc

              • elk.pyo

              • emt.py

              • emt.pyc

              • emt.pyo

              • exciting.py

              • exciting.pyc

              • exciting.pyo

              • ff.py

              • ff.pyc

              • ff.pyo

              • fleur.py

              • fleur.pyc

              • fleur.pyo

              • gaussian.py

              • gaussian.pyc

              • gaussian.pyo

              • general.py

              • general.pyc

              • general.pyo

              • gromacs.py

              • gromacs.pyc

              • gromacs.pyo

              • interface.py

              • interface.pyc

              • interface.pyo

              • interfacechecker.py

              • interfacechecker.pyc

              • interfacechecker.pyo

              • jacapo

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • changed.py

                • changed.pyc

                • changed.pyo

                • jacapo.py

                • jacapo.pyc

                • jacapo.pyo

                • lda_psp.py

                • lda_psp.pyc

                • lda_psp.pyo

                • mayavis.py

                • mayavis.pyc

                • mayavis.pyo

                • pbe_psp.py

                • pbe_psp.pyc

                • pbe_psp.pyo

                • pw91_psp.py

                • pw91_psp.pyc

                • pw91_psp.pyo

                • setup.py

                • setup.pyc

                • setup.pyo

                • utils

                  • __init__.py

                  • __init__.pyc

                  • __init__.pyo

                  • bader.py

                  • bader.pyc

                  • bader.pyo

                  • bandstructure.py

                  • bandstructure.pyc

                  • bandstructure.pyo

                  • bee.py

                  • bee.pyc

                  • bee.pyo

                  • findsym.py

                  • findsym.pyc

                  • findsym.pyo

                  • jmath.py

                  • jmath.pyc

                  • jmath.pyo

                  • sgroup.py

                  • sgroup.pyc

                  • sgroup.pyo

                  • symmol.py

                  • symmol.pyc

                  • symmol.pyo

                  • wannier.py

                  • wannier.pyc

                  • wannier.pyo

                • validate.py

                • validate.pyc

                • validate.pyo

                • version.py

                • version.pyc

                • version.pyo

              • lammpsrun.py

              • lammpsrun.pyc

              • lammpsrun.pyo

              • lj.py

              • lj.pyc

              • lj.pyo

              • loggingcalc.py

              • loggingcalc.pyc

              • loggingcalc.pyo

              • mopac.py

              • mopac.pyc

              • mopac.pyo

              • morse.py

              • morse.pyc

              • morse.pyo

              • neighborlist.py

              • neighborlist.pyc

              • neighborlist.pyo

              • nwchem.py

              • nwchem.pyc

              • nwchem.pyo

              • octopus.py

              • octopus.pyc

              • octopus.pyo

              • onetep.py

              • onetep.pyc

              • onetep.pyo

              • qmmm.py

              • qmmm.pyc

              • qmmm.pyo

              • siesta

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • base_siesta.py

                • base_siesta.pyc

                • base_siesta.pyo

                • import_functions.py

                • import_functions.pyc

                • import_functions.pyo

                • import_ion_xml.py

                • import_ion_xml.pyc

                • import_ion_xml.pyo

                • mbpt_lcao.py

                • mbpt_lcao.pyc

                • mbpt_lcao.pyo

                • mbpt_lcao_io.py

                • mbpt_lcao_io.pyc

                • mbpt_lcao_io.pyo

                • mbpt_lcao_utils.py

                • mbpt_lcao_utils.pyc

                • mbpt_lcao_utils.pyo

                • parameters.py

                • parameters.pyc

                • parameters.pyo

                • siesta.py

                • siesta.pyc

                • siesta.pyo

                • siesta_raman.py

                • siesta_raman.pyc

                • siesta_raman.pyo

              • singlepoint.py

              • singlepoint.pyc

              • singlepoint.pyo

              • test.py

              • test.pyc

              • test.pyo

              • tip3p.py

              • tip3p.pyc

              • tip3p.pyo

              • turbomole.py

              • turbomole.pyc

              • turbomole.pyo

              • vasp.py

              • vasp.pyc

              • vasp.pyo

              • vdwcorrection.py

              • vdwcorrection.pyc

              • vdwcorrection.pyo

            • cli

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • build.py

              • build.pyc

              • build.pyo

              • info.py

              • info.pyc

              • info.pyo

              • run.py

              • run.pyc

              • run.pyo

            • cluster

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • base.py

              • base.pyc

              • base.pyo

              • cluster.py

              • cluster.pyc

              • cluster.pyo

              • compounds.py

              • compounds.pyc

              • compounds.pyo

              • cubic.py

              • cubic.pyc

              • cubic.pyo

              • data

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • au.py

                • au.pyc

                • au.pyo

                • fcc.py

                • fcc.pyc

                • fcc.pyo

                • hcp.py

                • hcp.pyc

                • hcp.pyo

                • symmetry.py

                • symmetry.pyc

                • symmetry.pyo

              • decahedron.py

              • decahedron.pyc

              • decahedron.pyo

              • factory.py

              • factory.pyc

              • factory.pyo

              • hexagonal.py

              • hexagonal.pyc

              • hexagonal.pyo

              • icosahedron.py

              • icosahedron.pyc

              • icosahedron.pyo

              • octahedron.py

              • octahedron.pyc

              • octahedron.pyo

              • wulff.py

              • wulff.pyc

              • wulff.pyo

            • collections

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • collection.py

              • collection.pyc

              • collection.pyo

              • create.py

              • create.pyc

              • create.pyo

              • g2.json

              • s22.json

            • constraints.py

            • constraints.pyc

            • constraints.pyo

            • data

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • alternatives.py

              • alternatives.pyc

              • alternatives.pyo

              • cccbdb_ip.py

              • cccbdb_ip.pyc

              • cccbdb_ip.pyo

              • colors.py

              • colors.pyc

              • colors.pyo

              • dbh24.py

              • dbh24.pyc

              • dbh24.pyo

              • extra_molecules.py

              • extra_molecules.pyc

              • extra_molecules.pyo

              • g2.py

              • g2.pyc

              • g2.pyo

              • g2_1.py

              • g2_1.pyc

              • g2_1.pyo

              • g2_1_ref.py

              • g2_1_ref.pyc

              • g2_1_ref.pyo

              • g2_1_ref_g03.py

              • g2_1_ref_g03.pyc

              • g2_1_ref_g03.pyo

              • g2_1_ref_vasp.py

              • g2_1_ref_vasp.pyc

              • g2_1_ref_vasp.pyo

              • g2_1_ref_wien97.py

              • g2_1_ref_wien97.pyc

              • g2_1_ref_wien97.pyo

              • g2_2.py

              • g2_2.pyc

              • g2_2.pyo

              • gmtkn30.py

              • gmtkn30.pyc

              • gmtkn30.pyo

              • molecules.py

              • molecules.pyc

              • molecules.pyo

              • s22.py

              • s22.pyc

              • s22.pyo

              • tmfp06d.py

              • tmfp06d.pyc

              • tmfp06d.pyo

              • tmgmjbp04n.py

              • tmgmjbp04n.pyc

              • tmgmjbp04n.pyo

              • tmxr200x.py

              • tmxr200x.pyc

              • tmxr200x.pyo

              • tmxr200x_tm1r2006.py

              • tmxr200x_tm1r2006.pyc

              • tmxr200x_tm1r2006.pyo

              • tmxr200x_tm2r2007.py

              • tmxr200x_tm2r2007.pyc

              • tmxr200x_tm2r2007.pyo

              • tmxr200x_tm3r2008.py

              • tmxr200x_tm3r2008.pyc

              • tmxr200x_tm3r2008.pyo

              • vdw.py

              • vdw.pyc

              • vdw.pyo

            • db

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • __main__.py

              • __main__.pyc

              • __main__.pyo

              • app.py

              • app.pyc

              • app.pyo

              • cli.py

              • cli.pyc

              • cli.pyo

              • convert.py

              • convert.pyc

              • convert.pyo

              • core.py

              • core.pyc

              • core.pyo

              • jsondb.py

              • jsondb.pyc

              • jsondb.pyo

              • mysql.py

              • mysql.pyc

              • mysql.pyo

              • plot.py

              • plot.pyc

              • plot.pyo

              • postgresql.py

              • postgresql.pyc

              • postgresql.pyo

              • row.py

              • row.pyc

              • row.pyo

              • sqlite.py

              • sqlite.pyc

              • sqlite.pyo

              • static

                • style.css

                • table.js

              • summary.py

              • summary.pyc

              • summary.pyo

              • table.py

              • table.pyc

              • table.pyo

              • templates

                • layout.html

                • more.html

                • summary.html

                • table.html

            • dft

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • band_structure.py

              • band_structure.pyc

              • band_structure.pyo

              • bandgap.py

              • bandgap.pyc

              • bandgap.pyo

              • bee.py

              • bee.pyc

              • bee.pyo

              • dos.py

              • dos.pyc

              • dos.pyo

              • kpoints.py

              • kpoints.pyc

              • kpoints.pyo

              • pars_beefvdw.py

              • pars_beefvdw.pyc

              • pars_beefvdw.pyo

              • pars_mbeef.py

              • pars_mbeef.pyc

              • pars_mbeef.pyo

              • pars_mbeefvdw.py

              • pars_mbeefvdw.pyc

              • pars_mbeefvdw.pyo

              • stm.py

              • stm.pyc

              • stm.pyo

              • wannier.py

              • wannier.pyc

              • wannier.pyo

            • dimer.py

            • dimer.pyc

            • dimer.pyo

            • eos.py

            • eos.pyc

            • eos.pyo

            • ga

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • adsorbate_comparators.py

              • adsorbate_comparators.pyc

              • adsorbate_comparators.pyo

              • adsorbate_operators.py

              • adsorbate_operators.pyc

              • adsorbate_operators.pyo

              • convergence.py

              • convergence.pyc

              • convergence.pyo

              • cutandsplicepairing.py

              • cutandsplicepairing.pyc

              • cutandsplicepairing.pyo

              • data.py

              • data.pyc

              • data.pyo

              • element_crossovers.py

              • element_crossovers.pyc

              • element_crossovers.pyo

              • element_mutations.py

              • element_mutations.pyc

              • element_mutations.pyo

              • multiprocessingrun.py

              • multiprocessingrun.pyc

              • multiprocessingrun.pyo

              • offspring_creator.py

              • offspring_creator.pyc

              • offspring_creator.pyo

              • parallellocalrun.py

              • parallellocalrun.pyc

              • parallellocalrun.pyo

              • particle_comparator.py

              • particle_comparator.pyc

              • particle_comparator.pyo

              • particle_crossovers.py

              • particle_crossovers.pyc

              • particle_crossovers.pyo

              • particle_mutations.py

              • particle_mutations.pyc

              • particle_mutations.pyo

              • pbs_queue_run.py

              • pbs_queue_run.pyc

              • pbs_queue_run.pyo

              • population.py

              • population.pyc

              • population.pyo

              • relax_attaches.py

              • relax_attaches.pyc

              • relax_attaches.pyo

              • standard_comparators.py

              • standard_comparators.pyc

              • standard_comparators.pyo

              • standardmutations.py

              • standardmutations.pyc

              • standardmutations.pyo

              • startgenerator.py

              • startgenerator.pyc

              • startgenerator.pyo

              • utilities.py

              • utilities.pyc

              • utilities.pyo

            • geometry

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • cell.py

              • cell.pyc

              • cell.pyo

              • distance.py

              • distance.pyc

              • distance.pyo

              • geometry.py

              • geometry.pyc

              • geometry.pyo

            • gui

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • __main__.py

              • __main__.pyc

              • __main__.pyo

              • add.py

              • add.pyc

              • add.pyo

              • ag.py

              • ag.pyc

              • ag.pyo

              • calculator.py

              • calculator.pyc

              • calculator.pyo

              • colors.py

              • colors.pyc

              • colors.pyo

              • constraints.py

              • constraints.pyc

              • constraints.pyo

              • crystal.py

              • crystal.pyc

              • crystal.pyo

              • defaults.py

              • defaults.pyc

              • defaults.pyo

              • energyforces.py

              • energyforces.pyc

              • energyforces.pyo

              • execute.py

              • execute.pyc

              • execute.pyo

              • graphene.py

              • graphene.pyc

              • graphene.pyo

              • graphs.py

              • graphs.pyc

              • graphs.pyo

              • gui.py

              • gui.pyc

              • gui.pyo

              • i18n.py

              • i18n.pyc

              • i18n.pyo

              • images.py

              • images.pyc

              • images.pyo

              • minimize.py

              • minimize.pyc

              • minimize.pyo

              • modify.py

              • modify.pyc

              • modify.pyo

              • movie.py

              • movie.pyc

              • movie.pyo

              • nanoparticle.py

              • nanoparticle.pyc

              • nanoparticle.pyo

              • nanotube.py

              • nanotube.pyc

              • nanotube.pyo

              • neb.py

              • neb.pyc

              • neb.pyo

              • po

                • da

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

                • de

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

                • en_GB

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

                • es

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

                • gl

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

                • zh_CN

                  • LC_MESSAGES

                    • ag.mo

              • progress.py

              • progress.pyc

              • progress.pyo

              • quickinfo.py

              • quickinfo.pyc

              • quickinfo.pyo

              • render.py

              • render.pyc

              • render.pyo

              • repeat.py

              • repeat.pyc

              • repeat.pyo

              • rot_tools.py

              • rot_tools.pyc

              • rot_tools.pyo

              • rotate.py

              • rotate.pyc

              • rotate.pyo

              • save.py

              • save.pyc

              • save.pyo

              • settings.py

              • settings.pyc

              • settings.pyo

              • simulation.py

              • simulation.pyc

              • simulation.pyo

              • status.py

              • status.pyc

              • status.pyo

              • surfaceslab.py

              • surfaceslab.pyc

              • surfaceslab.pyo

              • ui.py

              • ui.pyc

              • ui.pyo

              • view.py

              • view.pyc

              • view.pyo

              • widgets.py

              • widgets.pyc

              • widgets.pyo

            • infrared.py

            • infrared.pyc

            • infrared.pyo

            • io

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • abinit.py

              • abinit.pyc

              • abinit.pyo

              • aff.py

              • aff.pyc

              • aff.pyo

              • aims.py

              • aims.pyc

              • aims.pyo

              • bader.py

              • bader.pyc

              • bader.pyo

              • bundlemanipulate.py

              • bundlemanipulate.pyc

              • bundlemanipulate.pyo

              • bundletrajectory.py

              • bundletrajectory.pyc

              • bundletrajectory.pyo

              • castep.py

              • castep.pyc

              • castep.pyo

              • cfg.py

              • cfg.pyc

              • cfg.pyo

              • cif.py

              • cif.pyc

              • cif.pyo

              • cmdft.py

              • cmdft.pyc

              • cmdft.pyo

              • cube.py

              • cube.pyc

              • cube.pyo

              • dacapo.py

              • dacapo.pyc

              • dacapo.pyo

              • db.py

              • db.pyc

              • db.pyo

              • dftb.py

              • dftb.pyc

              • dftb.pyo

              • elk.py

              • elk.pyc

              • elk.pyo

              • eon.py

              • eon.pyc

              • eon.pyo

              • eps.py

              • eps.pyc

              • eps.pyo

              • espresso.py

              • espresso.pyc

              • espresso.pyo

              • etsf.py

              • etsf.pyc

              • etsf.pyo

              • exciting.py

              • exciting.pyc

              • exciting.pyo

              • extxyz.py

              • extxyz.pyc

              • extxyz.pyo

              • findsym.py

              • findsym.pyc

              • findsym.pyo

              • foldtrajectory.py

              • foldtrajectory.pyc

              • foldtrajectory.pyo

              • formats.py

              • formats.pyc

              • formats.pyo

              • fortranfile.py

              • fortranfile.pyc

              • fortranfile.pyo

              • gaussian.py

              • gaussian.pyc

              • gaussian.pyo

              • gaussian_reader.py

              • gaussian_reader.pyc

              • gaussian_reader.pyo

              • gen.py

              • gen.pyc

              • gen.pyo

              • gpaw_out.py

              • gpaw_out.pyc

              • gpaw_out.pyo

              • gpw.py

              • gpw.pyc

              • gpw.pyo

              • gromacs.py

              • gromacs.pyc

              • gromacs.pyo

              • gromos.py

              • gromos.pyc

              • gromos.pyo

              • iwm.py

              • iwm.pyc

              • iwm.pyo

              • jsonio.py

              • jsonio.pyc

              • jsonio.pyo

              • jsv.py

              • jsv.pyc

              • jsv.pyo

              • lammpsdata.py

              • lammpsdata.pyc

              • lammpsdata.pyo

              • lammpsrun.py

              • lammpsrun.pyc

              • lammpsrun.pyo

              • magres.py

              • magres.pyc

              • magres.pyo

              • mol.py

              • mol.pyc

              • mol.pyo

              • netcdftrajectory.py

              • netcdftrajectory.pyc

              • netcdftrajectory.pyo

              • nwchem.py

              • nwchem.pyc

              • nwchem.pyo

              • octopus.py

              • octopus.pyc

              • octopus.pyo

              • opls.py

              • opls.pyc

              • opls.pyo

              • pickletrajectory.py

              • pickletrajectory.pyc

              • pickletrajectory.pyo

              • plt.py

              • plt.pyc

              • plt.pyo

              • png.py

              • png.pyc

              • png.pyo

              • pov.py

              • pov.pyc

              • pov.pyo

              • proteindatabank.py

              • proteindatabank.pyc

              • proteindatabank.pyo

              • py.py

              • py.pyc

              • py.pyo

              • res.py

              • res.pyc

              • res.pyo

              • sdf.py

              • sdf.pyc

              • sdf.pyo

              • siesta.py

              • siesta.pyc

              • siesta.pyo

              • trajectory.py

              • trajectory.pyc

              • trajectory.pyo

              • turbomole.py

              • turbomole.pyc

              • turbomole.pyo

              • ulm.py

              • ulm.pyc

              • ulm.pyo

              • v_sim.py

              • v_sim.pyc

              • v_sim.pyo

              • vasp.py

              • vasp.pyc

              • vasp.pyo

              • vtkxml.py

              • vtkxml.pyc

              • vtkxml.pyo

              • wien2k.py

              • wien2k.pyc

              • wien2k.pyo

              • x3d.py

              • x3d.pyc

              • x3d.pyo

              • xsd.py

              • xsd.pyc

              • xsd.pyo

              • xsf.py

              • xsf.pyc

              • xsf.pyo

              • xyz.py

              • xyz.pyc

              • xyz.pyo

            • lattice

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • bravais.py

              • bravais.pyc

              • bravais.pyo

              • compounds.py

              • compounds.pyc

              • compounds.pyo

              • cubic.py

              • cubic.pyc

              • cubic.pyo

              • hexagonal.py

              • hexagonal.pyc

              • hexagonal.pyo

              • monoclinic.py

              • monoclinic.pyc

              • monoclinic.pyo

              • orthorhombic.py

              • orthorhombic.pyc

              • orthorhombic.pyo

              • spacegroup.py

              • spacegroup.pyc

              • spacegroup.pyo

              • surface.py

              • surface.pyc

              • surface.pyo

              • tetragonal.py

              • tetragonal.pyc

              • tetragonal.pyo

              • triclinic.py

              • triclinic.pyc

              • triclinic.pyo

            • md

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • fix.py

              • fix.pyc

              • fix.pyo

              • langevin.py

              • langevin.pyc

              • langevin.pyo

              • logger.py

              • logger.pyc

              • logger.pyo

              • md.py

              • md.pyc

              • md.pyo

              • npt.py

              • npt.pyc

              • npt.pyo

              • nptberendsen.py

              • nptberendsen.pyc

              • nptberendsen.pyo

              • nvtberendsen.py

              • nvtberendsen.pyc

              • nvtberendsen.pyo

              • velocitydistribution.py

              • velocitydistribution.pyc

              • velocitydistribution.pyo

              • verlet.py

              • verlet.pyc

              • verlet.pyo

            • neb.py

            • neb.pyc

            • neb.pyo

            • neighborlist.py

            • neighborlist.pyc

            • neighborlist.pyo

            • optimize

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • basin.py

              • basin.pyc

              • basin.pyo

              • bfgs.py

              • bfgs.pyc

              • bfgs.pyo

              • bfgslinesearch.py

              • bfgslinesearch.pyc

              • bfgslinesearch.pyo

              • fire.py

              • fire.pyc

              • fire.pyo

              • fmin_bfgs.py

              • fmin_bfgs.pyc

              • fmin_bfgs.pyo

              • lbfgs.py

              • lbfgs.pyc

              • lbfgs.pyo

              • mdmin.py

              • mdmin.pyc

              • mdmin.pyo

              • minimahopping.py

              • minimahopping.pyc

              • minimahopping.pyo

              • oldqn.py

              • oldqn.pyc

              • oldqn.pyo

              • optimize.py

              • optimize.pyc

              • optimize.pyo

              • precon

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • fire.py

                • fire.pyc

                • fire.pyo

                • lbfgs.py

                • lbfgs.pyc

                • lbfgs.pyo

                • neighbors.py

                • neighbors.pyc

                • neighbors.pyo

                • precon.py

                • precon.pyc

                • precon.pyo

              • sciopt.py

              • sciopt.pyc

              • sciopt.pyo

              • test

                • C2_Cu100.py

                • C2_Cu100.pyc

                • C2_Cu100.pyo

                • C5H12.py

                • C5H12.pyc

                • C5H12.pyo

                • CO_Au111.py

                • CO_Au111.pyc

                • CO_Au111.pyo

                • Cu_bulk.py

                • Cu_bulk.pyc

                • Cu_bulk.pyo

                • H2.py

                • H2.pyc

                • H2.pyo

                • N2Cu_relax.py

                • N2Cu_relax.pyc

                • N2Cu_relax.pyo

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • generate_rst.py

                • generate_rst.pyc

                • generate_rst.pyo

                • nanoparticle.py

                • nanoparticle.pyc

                • nanoparticle.pyo

                • neb.py

                • neb.pyc

                • neb.pyo

                • test.py

                • test.pyc

                • test.pyo

            • parallel.py

            • parallel.pyc

            • parallel.pyo

            • phasediagram.py

            • phasediagram.pyc

            • phasediagram.pyo

            • phonons.py

            • phonons.pyc

            • phonons.pyo

            • quaternions.py

            • quaternions.pyc

            • quaternions.pyo

            • run.py

            • run.pyc

            • run.pyo

            • spacegroup

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • findsym.py

              • findsym.pyc

              • findsym.pyo

              • spacegroup.dat

              • spacegroup.py

              • spacegroup.pyc

              • spacegroup.pyo

              • xtal.py

              • xtal.pyc

              • xtal.pyo

            • structure.py

            • structure.pyc

            • structure.pyo

            • test

              • Ag-Cu100.py

              • Ag-Cu100.pyc

              • Ag-Cu100.pyo

              • CO2_Au111.py

              • CO2_Au111.pyc

              • CO2_Au111.pyo

              • COCu111.py

              • COCu111.pyc

              • COCu111.pyo

              • COCu111_2.py

              • COCu111_2.pyc

              • COCu111_2.pyo

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • __main__.py

              • __main__.pyc

              • __main__.pyo

              • abinit

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • abinit_Si.py

                • abinit_Si.pyc

                • abinit_Si.pyo

                • abinit_cmdline.py

                • abinit_cmdline.pyc

                • abinit_cmdline.pyo

              • ag.py

              • ag.pyc

              • ag.pyo

              • aims

                • H2O_aims.py

                • H2O_aims.pyc

                • H2O_aims.pyo

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • aims_cmdline.py

                • aims_cmdline.pyc

                • aims_cmdline.pyo

              • amber

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • amber.py

                • amber.pyc

                • amber.pyo

              • atom.py

              • atom.pyc

              • atom.pyo

              • atoms_distance.py

              • atoms_distance.pyc

              • atoms_distance.pyo

              • atoms_get_duplicates.py

              • atoms_get_duplicates.pyc

              • atoms_get_duplicates.pyo

              • atoms_info_copy.py

              • atoms_info_copy.pyc

              • atoms_info_copy.pyo

              • bader.py

              • bader.pyc

              • bader.pyo

              • bandgap.py

              • bandgap.pyc

              • bandgap.pyo

              • bandstructure.py

              • bandstructure.pyc

              • bandstructure.pyo

              • basin.py

              • basin.pyc

              • basin.pyo

              • build.py

              • build.pyc

              • build.pyo

              • bulk.py

              • bulk.pyc

              • bulk.pyo

              • c60.py

              • c60.pyc

              • c60.pyo

              • calculator

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • al.py

                • al.pyc

                • al.pyo

                • bandgap.py

                • bandgap.pyc

                • bandgap.pyo

                • h2.py

                • h2.pyc

                • h2.pyo

                • kd2mp.py

                • kd2mp.pyc

                • kd2mp.pyo

                • traj.py

                • traj.pyc

                • traj.pyo

              • castep

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • castep_interface.py

                • castep_interface.pyc

                • castep_interface.pyo

              • center.py

              • center.pyc

              • center.pyo

              • checkpoint.py

              • checkpoint.pyc

              • checkpoint.pyo

              • com.py

              • com.pyc

              • com.pyo

              • constraints

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • fixatoms.py

                • fixatoms.pyc

                • fixatoms.pyo

                • fixbonds.py

                • fixbonds.pyc

                • fixbonds.pyo

                • getindices.py

                • getindices.pyc

                • getindices.pyo

                • setpos.py

                • setpos.pyc

                • setpos.pyo

              • coverage.py

              • coverage.pyc

              • coverage.pyo

              • cp2k

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • cp2k_GeoOpt.py

                • cp2k_GeoOpt.pyc

                • cp2k_GeoOpt.pyo

                • cp2k_H2_LDA.py

                • cp2k_H2_LDA.pyc

                • cp2k_H2_LDA.pyo

                • cp2k_H2_LS.py

                • cp2k_H2_LS.pyc

                • cp2k_H2_LS.pyo

                • cp2k_H2_None.py

                • cp2k_H2_None.pyc

                • cp2k_H2_None.pyo

                • cp2k_H2_PBE.py

                • cp2k_H2_PBE.pyc

                • cp2k_H2_PBE.pyo

                • cp2k_H2_libxc.py

                • cp2k_H2_libxc.pyc

                • cp2k_H2_libxc.pyo

                • cp2k_MD.py

                • cp2k_MD.pyc

                • cp2k_MD.pyo

                • cp2k_O2.py

                • cp2k_O2.pyc

                • cp2k_O2.pyo

                • cp2k_restart.py

                • cp2k_restart.pyc

                • cp2k_restart.pyo

                • cp2k_stress.py

                • cp2k_stress.pyc

                • cp2k_stress.pyo

              • crystal.py

              • crystal.pyc

              • crystal.pyo

              • db.py

              • db.pyc

              • db.pyo

              • db2.py

              • db2.pyc

              • db2.pyo

              • db_web.py

              • db_web.pyc

              • db_web.pyo

              • demon

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • h2o.py

                • h2o.pyc

                • h2o.pyo

              • dependency_gtk.py

              • dependency_gtk.pyc

              • dependency_gtk.pyo

              • dependency_matplotlib.py

              • dependency_matplotlib.pyc

              • dependency_matplotlib.pyo

              • dft

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • bandgap.py

                • bandgap.pyc

                • bandgap.pyo

              • dftb

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • test_simple.py

                • test_simple.pyc

                • test_simple.pyo

                • test_tricky.py

                • test_tricky.pyc

                • test_tricky.pyo

              • dihedralconstraint.py

              • dihedralconstraint.pyc

              • dihedralconstraint.pyo

              • dimer.py

              • dimer.pyc

              • dimer.pyo

              • dimer_method.py

              • dimer_method.pyc

              • dimer_method.pyo

              • distance.py

              • distance.pyc

              • distance.pyo

              • distmom.py

              • distmom.pyc

              • distmom.pyo

              • doctests.py

              • doctests.pyc

              • doctests.pyo

              • eam_pot.py

              • eam_pot.pyc

              • eam_pot.pyo

              • eam_pot_test.py

              • eam_pot_test.pyc

              • eam_pot_test.pyo

              • eam_test.py

              • eam_test.pyc

              • eam_test.pyo

              • elk

                • Al_rmt.py

                • Al_rmt.pyc

                • Al_rmt.pyo

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • elk_cmdline.py

                • elk_cmdline.pyc

                • elk_cmdline.pyo

              • emt.py

              • emt.pyc

              • emt.pyo

              • emt1.py

              • emt1.pyc

              • emt1.pyo

              • emt2.py

              • emt2.pyc

              • emt2.pyo

              • emt_h3o2m.py

              • emt_h3o2m.pyc

              • emt_h3o2m.pyo

              • eon

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • eon_masses.py

                • eon_masses.pyc

                • eon_masses.pyo

                • eon_readwrite.py

                • eon_readwrite.pyc

                • eon_readwrite.pyo

              • eos.py

              • eos.pyc

              • eos.pyo

              • example.py

              • example.pyc

              • example.pyo

              • exciting

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • exciting.py

                • exciting.pyc

                • exciting.pyo

              • external_force.py

              • external_force.pyc

              • external_force.pyo

              • filter.py

              • filter.pyc

              • filter.pyo

              • fio

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • abinit.py

                • abinit.pyc

                • abinit.pyo

                • cfg.py

                • cfg.pyc

                • cfg.pyo

                • extxyz.py

                • extxyz.pyc

                • extxyz.pyo

                • info.py

                • info.pyc

                • info.pyo

                • jsonio.py

                • jsonio.pyc

                • jsonio.pyo

                • magmom.py

                • magmom.pyc

                • magmom.pyo

                • netcdftrajectory.py

                • netcdftrajectory.pyc

                • netcdftrajectory.pyo

                • nwchem.py

                • nwchem.pyc

                • nwchem.pyo

                • oi.py

                • oi.pyc

                • oi.pyo

                • oldtraj.py

                • oldtraj.pyc

                • oldtraj.pyo

                • res.py

                • res.pyc

                • res.pyo

                • trajectory.py

                • trajectory.pyc

                • trajectory.pyo

                • ulm.py

                • ulm.pyc

                • ulm.pyo

                • v_sim.py

                • v_sim.pyc

                • v_sim.pyo

                • vasp_out.py

                • vasp_out.pyc

                • vasp_out.pyo

                • xsf_spec.py

                • xsf_spec.pyc

                • xsf_spec.pyo

              • fire.py

              • fire.pyc

              • fire.pyo

              • fix_bond_length_mic.py

              • fix_bond_length_mic.pyc

              • fix_bond_length_mic.pyo

              • fleur

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • fleur_cmdline.py

                • fleur_cmdline.pyc

                • fleur_cmdline.pyo

              • franck_condon.py

              • franck_condon.pyc

              • franck_condon.pyo

              • ga

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • basic_example_create_database.py

                • basic_example_create_database.pyc

                • basic_example_create_database.pyo

                • basic_example_main_run.py

                • basic_example_main_run.pyc

                • basic_example_main_run.pyo

                • create_database.py

                • create_database.pyc

                • create_database.pyo

                • cutandsplicepairing.py

                • cutandsplicepairing.pyc

                • cutandsplicepairing.pyo

                • database_logic.py

                • database_logic.pyc

                • database_logic.pyo

                • element_operators.py

                • element_operators.pyc

                • element_operators.pyo

                • mutations.py

                • mutations.pyc

                • mutations.pyo

                • particle_comparators.py

                • particle_comparators.pyc

                • particle_comparators.pyo

                • particle_operators.py

                • particle_operators.pyc

                • particle_operators.pyo

                • standardcomparator.py

                • standardcomparator.pyc

                • standardcomparator.pyo

                • utilities.py

                • utilities.pyc

                • utilities.pyo

              • gaussian

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • gaussian_cmdline.py

                • gaussian_cmdline.pyc

                • gaussian_cmdline.pyo

                • h2of.py

                • h2of.pyc

                • h2of.pyo

                • water.py

                • water.pyc

                • water.pyo

              • geometry.py

              • geometry.pyc

              • geometry.pyo

              • gpaw

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • no_spin_and_spin.py

                • no_spin_and_spin.pyc

                • no_spin_and_spin.pyo

              • gromacs

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • test_gromacs.py

                • test_gromacs.pyc

                • test_gromacs.pyo

              • gui

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • run.py

                • run.pyc

                • run.pyo

                • ui.py

                • ui.pyc

                • ui.pyo

              • h2.py

              • h2.pyc

              • h2.pyo

              • hcp.py

              • hcp.pyc

              • hcp.pyo

              • hookean.py

              • hookean.pyc

              • hookean.pyo

              • idpp.py

              • idpp.pyc

              • idpp.pyo

              • jacapo

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • jacapo.py

                • jacapo.pyc

                • jacapo.pyo

              • kpts.py

              • kpts.pyc

              • kpts.pyo

              • lammpsdata

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • lammpsdata.py

                • lammpsdata.pyc

                • lammpsdata.pyo

              • langevin.py

              • langevin.pyc

              • langevin.pyo

              • maxwellboltzmann.py

              • maxwellboltzmann.pyc

              • maxwellboltzmann.pyo

              • md.py

              • md.pyc

              • md.pyo

              • mic.py

              • mic.pyc

              • mic.pyo

              • minimahop.py

              • minimahop.pyc

              • minimahop.pyo

              • mopac.py

              • mopac.pyc

              • mopac.pyo

              • n2.py

              • n2.pyc

              • n2.pyo

              • neb.py

              • neb.pyc

              • neb.pyo

              • neb_tr.py

              • neb_tr.pyc

              • neb_tr.pyo

              • neighbor.py

              • neighbor.pyc

              • neighbor.pyo

              • niggli.py

              • niggli.pyc

              • niggli.pyo

              • noncollinear.py

              • noncollinear.pyc

              • noncollinear.pyo

              • nwchem

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • nwchem_broken_symmetry.py

                • nwchem_broken_symmetry.pyc

                • nwchem_broken_symmetry.pyo

                • nwchem_cmdline.py

                • nwchem_cmdline.pyc

                • nwchem_cmdline.pyo

                • nwchem_h3o2m.py

                • nwchem_h3o2m.pyc

                • nwchem_h3o2m.pyo

                • nwchem_spin_symmetry.py

                • nwchem_spin_symmetry.pyc

                • nwchem_spin_symmetry.pyo

                • nwchem_strong_levelshift.py

                • nwchem_strong_levelshift.pyc

                • nwchem_strong_levelshift.pyo

              • octopus

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • big-test.py

                • big-test.pyc

                • big-test.pyo

                • restart-octopus.py

                • restart-octopus.pyc

                • restart-octopus.pyo

                • test-octopus.py

                • test-octopus.pyc

                • test-octopus.pyo

              • onetep

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • onetep.py

                • onetep.pyc

                • onetep.pyo

              • pourbaix.py

              • pourbaix.pyc

              • pourbaix.pyo

              • preconlbfgs.py

              • preconlbfgs.pyc

              • preconlbfgs.pyo

              • properties.py

              • properties.pyc

              • properties.pyo

              • pull.py

              • pull.pyc

              • pull.pyo

              • qmmm.py

              • qmmm.pyc

              • qmmm.pyo

              • quaternions.py

              • quaternions.pyc

              • quaternions.pyo

              • rattle.py

              • rattle.pyc

              • rattle.pyo

              • repeat_FixAtoms.py

              • repeat_FixAtoms.pyc

              • repeat_FixAtoms.pyo

              • replay.py

              • replay.pyc

              • replay.pyo

              • root_test.py

              • root_test.pyc

              • root_test.pyo

              • rotate.py

              • rotate.pyc

              • rotate.pyo

              • rotate_euler.py

              • rotate_euler.pyc

              • rotate_euler.pyo

              • s22.py

              • s22.pyc

              • s22.pyo

              • scaled_positions.py

              • scaled_positions.pyc

              • scaled_positions.pyo

              • scientificpython_bug.py

              • scientificpython_bug.pyc

              • scientificpython_bug.pyo

              • set_get_angle.py

              • set_get_angle.pyc

              • set_get_angle.pyo

              • set_momenta.py

              • set_momenta.pyc

              • set_momenta.pyo

              • siesta

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • mbpt_lcao

                  • __init__.py

                  • __init__.pyc

                  • __init__.pyo

                  • script_mbpt_lcao.py

                  • script_mbpt_lcao.pyc

                  • script_mbpt_lcao.pyo

                  • script_raman.py

                  • script_raman.pyc

                  • script_raman.pyo

                • siesta.py

                • siesta.pyc

                • siesta.pyo

                • test_scripts

                  • CH4

                    • __init__.py

                    • __init__.pyc

                    • __init__.pyo

                    • script.py

                    • script.pyc

                    • script.pyo

                  • H2

                    • __init__.py

                    • __init__.pyc

                    • __init__.pyo

                    • script.py

                    • script.pyc

                    • script.pyo

                  • Na8

                    • __init__.py

                    • __init__.pyc

                    • __init__.pyo

                    • script.py

                    • script.pyc

                    • script.pyo

                  • Si

                    • __init__.py

                    • __init__.pyc

                    • __init__.pyo

                    • script.py

                    • script.pyc

                    • script.pyo

                  • __init__.py

                  • __init__.pyc

                  • __init__.pyo

              • singlepointcalc.py

              • singlepointcalc.pyc

              • singlepointcalc.pyo

              • stm.py

              • stm.pyc

              • stm.pyo

              • strain.py

              • strain.pyc

              • strain.pyo

              • strain_emt.py

              • strain_emt.pyc

              • strain_emt.pyo

              • stress.py

              • stress.pyc

              • stress.pyo

              • surface.py

              • surface.pyc

              • surface.pyo

              • thermochemistry.py

              • thermochemistry.pyc

              • thermochemistry.pyo

              • things.py

              • things.pyc

              • things.pyo

              • tip3p.py

              • tip3p.pyc

              • tip3p.pyo

              • turbomole

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • turbomole_H2.py

                • turbomole_H2.pyc

                • turbomole_H2.pyo

                • turbomole_h3o2m.py

                • turbomole_h3o2m.pyc

                • turbomole_h3o2m.pyo

              • unitcellfilter.py

              • unitcellfilter.pyc

              • unitcellfilter.pyo

              • unitcellfilter2.py

              • unitcellfilter2.pyc

              • unitcellfilter2.pyo

              • units.py

              • units.pyc

              • units.pyo

              • vacancy.py

              • vacancy.pyc

              • vacancy.pyo

              • vasp

                • __init__.py

                • __init__.pyc

                • __init__.pyo

                • vasp_Al_volrelax.py

                • vasp_Al_volrelax.pyc

                • vasp_Al_volrelax.pyo

                • vasp_cell.py

                • vasp_cell.pyc

                • vasp_cell.pyo

                • vasp_co.py

                • vasp_co.pyc

                • vasp_co.pyo

                • vasp_kpoints.py

                • vasp_kpoints.pyc

                • vasp_kpoints.pyo

                • vasp_xc.py

                • vasp_xc.pyc

                • vasp_xc.pyo

                • vasp_xml.py

                • vasp_xml.pyc

                • vasp_xml.pyo

              • verlet.py

              • verlet.pyc

              • verlet.pyo

              • vib.py

              • vib.pyc

              • vib.pyo

            • thermochemistry.py

            • thermochemistry.pyc

            • thermochemistry.pyo

            • transport

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • calculators.py

              • calculators.pyc

              • calculators.pyo

              • greenfunction.py

              • greenfunction.pyc

              • greenfunction.pyo

              • selfenergy.py

              • selfenergy.pyc

              • selfenergy.pyo

              • stm.py

              • stm.pyc

              • stm.pyo

              • stm_test.py

              • stm_test.pyc

              • stm_test.pyo

              • test_transport_calulator.py

              • test_transport_calulator.pyc

              • test_transport_calulator.pyo

              • tools.py

              • tools.pyc

              • tools.pyo

            • units.py

            • units.pyc

            • units.pyo

            • utils

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • _linprog.py

              • _linprog.pyc

              • _linprog.pyo

              • bee.py

              • bee.pyc

              • bee.pyo

              • build_web_page.py

              • build_web_page.pyc

              • build_web_page.pyo

              • distance.py

              • distance.pyc

              • distance.pyo

              • eos.py

              • eos.pyc

              • eos.pyo

              • extrapolate.py

              • extrapolate.pyc

              • extrapolate.pyo

              • ff.py

              • ff.pyc

              • ff.pyo

              • geometry.py

              • geometry.pyc

              • geometry.pyo

              • linesearch.py

              • linesearch.pyc

              • linesearch.pyo

              • linesearcharmijo.py

              • linesearcharmijo.pyc

              • linesearcharmijo.pyo

              • memory.py

              • memory.pyc

              • memory.pyo

              • sphinx.py

              • sphinx.pyc

              • sphinx.pyo

              • stylecheck.py

              • stylecheck.pyc

              • stylecheck.pyo

              • timing.py

              • timing.pyc

              • timing.pyo

            • vibrations

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • franck_condon.py

              • franck_condon.pyc

              • franck_condon.pyo

              • infrared.py

              • infrared.pyc

              • infrared.pyo

              • resonant_raman.py

              • resonant_raman.pyc

              • resonant_raman.pyo

              • vibrations.py

              • vibrations.pyc

              • vibrations.pyo

            • visualize

              • __init__.py

              • __init__.pyc

              • __init__.pyo

              • colortable.py

              • colortable.pyc

              • colortable.pyo

              • fieldplotter.py

              • fieldplotter.pyc

              • fieldplotter.pyo

              • mlab.py

              • mlab.pyc

              • mlab.pyo

              • primiplotter.py

              • primiplotter.pyc

              • primiplotter.pyo

              • sage.py

              • sage.pyc

              • sage.pyo

            • xrdebye.py

            • xrdebye.pyc

            • xrdebye.pyo

          • ase-3.13.0-py2.7.egg-info

    • share

      • applications

        • ase-gui.desktop

      • doc

        • python-ase-3.13.0

          • COPYING

          • COPYING.LESSER

          • LICENSE

          • README.rst

      • pixmaps

        • ase.png